击败终极歼灭者后，变形海阳博士为帮助众人返回现世空间而启动聚核基因石，联盟却不慎引起能量爆炸。越空勇爆炸的动漫基因石碎片进入了不同的空间缝隙，引起空间缝隙能量失衡，变形导致大量时空异常现象出现。联盟为避免时空交错，越空勇引发空间混乱，动漫海澄与变形联盟四位成员开始寻找并修复出现的变形空间缝隙。另一边，联盟浩肯星一方也派出精锐部队来到地球，越空勇旨在抢夺基因石碎片能量，动漫消灭变形联盟。变形面对修复空间缝隙的联盟艰巨任务，面对来自浩肯星新的越空勇敌人和威胁，海澄和变形联盟成员毫不退缩，全力以赴。他们凭着过人的机智，同伴间的信赖，以及面对强敌的勇敢无惧，粉碎了敌人的一系列行动计划，击倒了强大的对手，最终守护了时空的平衡与地球的和平。 收起